转录因子ChIP-seq整体服务
项目简介
基因的转录调控是生物基因表达调控层次中最关键的一层，而转录因子是参与基因表达调控的一类重要的细胞核蛋白质。转录因子通过特异性结合调控区域的dna序列来调控基因转录过程，因此在全基因组水平将转录因子定位于靶基因dna是认识转录调控网络的有效方法之一。
通过转录因子chip-seq技术能够揭示转录因子的结合位点和确定直接的靶基因序列，可在体内分析特定启动子的分子调控机制。chip-seq已广泛应用于研究一些经典转录因子和一些新的转录因子在全基因组上的结合情况，实现全基因组层面分析一些经典的转录因子的调控网络，或为新转录因子的功能研究提供一些线索。
表观生物技术团队具备丰富的chip实验经验，利用经验证的chip级抗体，提供高质量转录因子免疫共沉淀服务，并结合新一代高通量测序技术，为生物医学研究人员提供转录因子研究整体服务（chip-seq）。
项目流程 ：
样本要求：
仅限人及大鼠或小鼠细胞
细胞量达到107个
组织样本需评估
测序模式：
se50
测序数据量：
20m
生物信息分析内容
一、标准信息分析
1. 去接头污染，去低质量reads和测序质量评估
2. chip测序序列与参考基因组序列的比对
3. chip测序唯一reads在全基因组的分布
4. peak鉴定及基因原件分析
5. peak相关基因筛选与go功能聚类分析、pathway分析
二、高级信息分析
可根据客户的需求，定制高级信息分析内容。
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